Одними из самых известных фильмов с участием актрисы стали  «Люди Икс» и «Люди Икс 2» (2000, 2003). Эти картины стали первыми фильмами о супергероях, в которых принимала участие Берри. В фильмах ей довелось играть роль мутанта по имени Шторм, имеющую способность управлять погодой. Сами же фильмы рассказывают о мутантах, которые отличались от людей тем, что имели необычные способности. Несколько частей «Людей Икс» сообща собрали внушительные кассовые сборы и являются одними из лучших фильмов в жанре картин о супергероях.  Неслучайно вышло очередное продолжение картины в 2006 году. Хэлли приняла участие и в съемках фильма «Людей Икс: Последняя битва».

Благодаря фильму «Бал монстров» (2001) Берри получила премию Оскар. Она сыграла жену казненного убийцы Летицию. В картине идет речь о традиции одной семьи продолжать заниматься одной и той же профессией. Все бы ничего, но эта профессия – палач… Фильм с участием Берри получил широкую известность в среде киноманов.

Одну из самых известных и одновременно тяжелых для актрисы ролей ей пришлось сыграть в психологическом триллере  «Готика» (2003). Сюжет фильма заключается в следующем. Главная героиня попадает в больницу для душевно больных. Совсем недавно она сама была здесь врачом, а теперь уже героиня сидит по другую сторону здравого смысла и обвиняется в убийстве, о котором совсем ничего не помнит.

Продолжая традицию супергероев, Хэлли снялась в фильме «Женщина-кошка» (2004). До нее несколько актрис отказались от роли, а сама картина получила 4 «Золотых малины». Но все же роль Пейшинс Филлипс не осталась незамеченной.

Ситуацию с «малиной» исправил фильм «Облачный атлас» (2012), который получил номинацию на Золотой глобус. Фильм стал вершиной актерского мастерства для актрисы, ведь здесь ей довелось играть сразу пять персонажей.

Среди других известных фильмов с участием Берри можно выделить следующие: «Умри, но не сейчас» (2002),  «Роботы» (2005),  «То, что мы потеряли»  (2007), «Заклинательница акул» (2012).