Прокариоты объединены в одно царство - Дробянки. К этому царству также относятся сине-зеленные водоросли и бактерии.

Прокариотические клетки значительно меньше эукариотических. Их размер не превышает, как правило, 10 мкм.

Кольцевая ДНК у прокариот находится в центре клетки и не имеет оболочки. Она располагается в цитоплазме. Эукариоты, наоборот, ДНК хранят в ядре, которое отсутствует у их предшественников.

Эукариоты и прокариоты снаружи покрыты плазматической мембранной. В клетках прокариот отсутствует ЭПС - эндоплазматическая сеть, пластиды, метахондрии, лизосомы и комплекс Гольджи. Функции этих мембранных органоидов выполняют мезосомы.

Эукариоты, как правило, являются аэробами. Они используют кислород в энергетическом обмене. Прокариоты, наоборот, являются анаэробами и для них кислород вреден.

Прокариотические клетки размножаются бесполым путем. Другими словами, они делятся. Их ДНК удваивается и клетка разделяется пополам в поперечной плоскости. Такие клетки способны размножаться каждые 20 минут, но это только в благоприятных условиях, которых быть не может.

Также прокариоты не имеют пищеварительной вакуоли, не способны к митозу и мейозу, и не имеют гамет.