Однозначного ответа на этот вопрос нет - он относителен к предпочтениям пользователя. Но свои сильные и слабые стороны имеет каждая из них.
Android разработана корпорацей Google относительно недавно, но уже за столь короткий период разработчики сумели довести свой продукт до конкурентно способного состояния с самим Apple. Так как ОС основана на Linux, то для разработчиков программ это полная свобода действий, т.к. система имеет открытый код. Для пользователя преимущества налицо - большой выбор всевозможного ПО, как платного так и бесплатного. В виду гибкости Linux, посредством программ можно настраивать систему как угодно: от смены "звонилки" и окружения рабочего стола до полного доступа к низким уровням системы. Ни производитель ни пользователь практически не ограничены ничем. К тому же Android имеет надежную защиту от вирусов, и при должной внимательности само ничего не установится.
iOS разработана компанией Apple относительно давно, и главное её преимущество - быстродействие и стабильность. Молниеносная скорость работы iOS таится прежде всего в аппаратной части устройства, которое создано специально для этой ОС. Отсюда же и стабильность. Другими словами, "железо" умеет работать только с iOS и больше ни с чем. Компания Apple ведет закрытую политику во всех отношениях, поэтому ни один производитель не может создать телефон на iOS, в отличии от Android, где каждый производитель делает устройства разного класса.

Если Вы хотите от телефона гибкости, стоит выбрать Android. К тому же последние версии этой ОС очень хорошо оптимизированы, вследствии чего на мощных смартфонах Android "летает" не хуже iOS.
Если Вам не важно все это, а просто нужна скорость, стабильность и премиальность, то iPhone - ваш выбор.