Ситуация встречается не так часто, но бывает и такое. Скорее всего предыдущий собственник двигателя не оформил документально замену двигателя на своем авто, поэтому в ГИБДД отсутствует необходимая для вас информация. Единственный выход - начать процедуру "узоканивания" вашего изменения в конструкции. Необходимо в первую очередь попросить представителей ГИБДД уточнить информацию о транспортном средстве, на котором раньше стоял двигатель и о его владельце (контакты), а затем связаться с ним и попросить оформить передачу двигателя на законном основании. Других разумных путей я, к сожалению, не вижу.